O SEEG é realizado pelas equipes do Observatório do Clima e de 5 organizações-membro que dividem o trabalho de acordo com seu campo de atuação. Atualmente o Iclei é responsável pelo setor de Resíduos, o Iema pelos setores de Energia e Indústria, Imaflora pela Agropecuária, e o Ipam e por Mudança de Uso da Terra e Florestas (dado seguimento ao trabalho do Imazon). O SEEG também conta com o parceiro de tecnologia Ecostage e outros colaboradores.